汐止基督長老教會是由馬偕博士所開闢。

馬偕博士在1872年九月26日首次抵達汐止，當日，馬偕博士和門徒數人在汐止以徒步佈道，並用獻詩、分發單張傳福音。1874年，在基隆河沿岸的南港（三重埔）設立教會，成為馬偕博士北部傳福音的重大據點。

三重埔教會設立以後，住在汐止的信徒陳熊、曾恩等人，週日禮拜時，就從汐止徒步到南港做禮拜，後來，汐止的信徒漸多，往返三重埔到汐止相當不便，因此，1875年九月在馬偕博士設立了錫口教會（松山）後，馬偕博士遂在1882年的一月二日，廢止了南港教會，在汐止設立了汐止教會，汐止教會於焉誕生。

汐止教會設立初始，汐止人口不過4千人，經過幾十年的變化，如今汐止人口已超過三十萬人，成為台北市旁的明星城市。汐止教會創立至今，一百多年，跟著汐止一起成長，未來，這間教會不僅是汐止人的信仰中心，更是汐止重要的史蹟與人文記錄的標記。